東京 i CDCにおける変異株スクリーニングの状況について（第1755報）

東京 i CDCでは、都内での変異株の発生状況を把握するため、昨年12月に「新型コロナウイルスのゲノム解析に関する検討チーム」を立ち上げ、東京都健康安全研究センター（以下、「健安研」という）において、都内における遺伝子変異の有無のスクリーニングを進めています。本年2月からは、民間検査機関においても変異株のスクリーニングを実施するなど、都内におけるスクリーニング体制を強化しています。
厚生労働省から、3月8日以降、変異株事例の公表について「自治体において公表する際には、変異株PCR検査で陽性となった時点で変異株事例として公表いただいて差支えありません」との通知があったため、以後は、健安研等において変異株PCR検査の陽性が判明した際に公表することとします。
このたび、海外とのリンクが確認された検体の変異株PCR検査により、4例が陽性となりましたのでお知らせします。
なお、報道機関各位におかれましては、ご本人やご家族などが特定されないよう、個人情報保護にご配慮下さい。

1　変異株の発生状況

（1）発生例（今回発生分）

4例（いずれも海外リンクあり）　
※上記のほか、都内でこれまで、変異株スクリーニングで陽性となったものは、合計8例あります。内訳は、国立感染症研究所（以下、「感染研」という）においてゲノム解析で確定に至らなかった例^【注】が6例、感染研のゲノム解析で確定された例が2例となります。

【注】確定に至らなかった例…対象となる検体のウイルス量が少ない等の場合、ゲノム解析の結果、確定が困難な場合があります。

患者情報（今回発生分）

	年代	性別	居住地	症状・経過	備考
1）	50代	男性	東京都	2月下旬発症 3月上旬入院	2月25日UAEから入国不特定多数との接触なし
2）	60代	男性	東京都	3月上旬発症 3月上旬入院	2月25日UAEから入国不特定多数との接触なし
3）	30代	女性	東京都	無症状 3月上旬入院	海外の滞在歴なし 2）の濃厚接触者不特定多数との接触なし
4）	50代	男性	東京都	3月上旬発症 3月上旬入院	海外の滞在歴なし 2）の濃厚接触者不特定多数との接触なし

※この4例は現在、感染研においてゲノム解析を行っているところです。

（2）これまでのスクリーニング検査実施数

内訳

		合計数	12月27日まで	12月28日-1月3日	1月4日-1月10日	1月11日-1月17日	1月18日-1月24日	1月25日-1月31日	2月1日-2月7日	2月8日-2月14日	2月15日-2月21日	2月22日-2月28日	3月1日-3月7日	3月8日-3月9日
スクリーニング実施数		2,775	189	180	482	371	285	246	135	367	241	187	80	12
	健安研	2,189	189	180	482	371	285	246	135	107	69	65	48	12
	民間検査機関	586	ー	ー	ー	ー	ー	ー	ー	260	172	122	32	ー
陽性例の数		12	0	0	0	1	1	2	1	3	0	0	3	1
	健安研	12	0	0	0	1	1	2	1	3	0	0	3	1
	民間検査機関	0	ー	ー	ー	ー	ー	ー	ー	0	0	0	0	ー
(うちゲノム解析確定例数)		2	0	0	0	0	1	1	0	0	0	0	0	0
	健安研	2	0	0	0	0	1	1	0	0	0	0	0	0
	民間検査機関	0	ー	ー	ー	ー	ー	ー	ー	0	0	0	0	ー

※「スクリーニング実施数」のうち、12月27日までの189件には、感染研に送付して実施した69件を含む
※民間検査機関の実施数は、2月8日から3月1日までの報告の数をもとに記載
※陽性例は、「海外リンクあり」が4例、「海外リンクなし」が8例

2　今後の対応

現在のところ、都内で変異株が市中に広がっていることは確認されていませんが、都としては、保健所と連携して疫学調査を進めるとともに、今後広がってくる可能性も視野に入れ、引き続き国や民間検査機関等と連携してスクリーニングを行い、感染拡大防止対策に努めてまいります。

参考

国における変異株ゲノム解析による確定例（東京都分）

合計			14
	海外への渡航歴ありまたはその接触者		8
		健安研でのスクリーニング後、感染研で確定	0
		健安研でのスクリーニングを経ずに、感染研で確定	8
	海外とのリンクなし		6
		健安研でのスクリーニング後、感染研で確定	2
		健安研のスクリーニングをもとに接触者を調査し、感染研で確定	4

※ゲノム解析による確定例…変異株のスクリーニングにより陽性となった検体について、感染研のゲノム解析により変異株と確定された例
※ゲノム解析による確定例は全て英国で報告された変異株

健安研による変異株スクリーニングのスキーム

都内で採取された検体の一部が各保健所より健安研に持ち込まれる。
同センターの新型コロナウイルス検査（PCR検査等）により陽性となった検体について、リアルタイムPCR法により変異株のスクリーニングを行う。
スクリーニングの結果、「変異株陽性」となった場合、感染研に検体を送付し、確定検査を行う。

都における変異株のスクリーニングの流れ

都における変異株スクリーニングの流れ図